水稻恶苗病发生的原因：恶苗病的发生与气温，水稻种子的抗性，播种过密，棚温长时间超过32度，在低温时候育苗都有关系。浸种的时间不够，水稻浸种的原则是温度越高，浸种时间越短，温度越低浸种时间越长。水温30度，浸种3天，水温20度，浸种4天，水温15度，浸种5天，水温10度，浸种7天。北方浸种水温低于10度，往往7天以上。
带菌种子和病稻草是水稻恶苗病病发生的初侵染源。浸种时带菌种子上的分生孢子污染无病种子而传染。
种子带菌和地块带菌是发病的主要原因。
水稻恶苗病主要是种子带菌引起的，可在浸种的时候，加咪鲜胺一起浸种。
水稻恶苗病菌是种子带菌传播。