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在分蘖期，根茎部产生褐斑，叶鞘发生褐色腐烂，严重时也可引起幼苗死亡。成株期在叶片或叶鞘上，最初产生黑褐色梭形病斑，以后扩大变为椭圆形或不规则形褐斑，中央灰白色至淡褐色，边缘不明显。在空气湿润和多雨期间，病斑上产生黑色霉状物，用手容易抹掉(与球霉病，颖枯病和叶枯病不易用手抹掉不同)。叶鞘上的病斑还可引起茎节发病。
小麦根腐病在分蘖期根茎部产生褐斑，叶鞘发生褐色腐烂，严重时引起幼苗死亡等。
