有的种子在成熟收割后，其胚胎在舒适的环境下仍然不能发芽，原因就是有休眠旗。
种子休眠是，有生命力的种子由于胚或种壳的因素，在适宜的环境条件下仍不能萌发的现象。休眠是植物在长期系统发育过程中获得的一种抵抗不良环境的适应性，是调节种子萌发的最佳时间和空间分布的有效方法。具有休眠特性的农作物种子在高温多雨地区可防止穗发芽；某些沙漠植物的种子可以休眠状态度过干旱季节，以待合适的萌发条件。
种子的休眠指具有生活力的种子，处在适宜的萌发条件下却不能萌发的现象。种子休眠时间的长短差异很大，有的需要几周，有的需要几个月，有的需要二三年，甚至更长。类型主要有胚发育不完全、胚生理上未成熟或种皮坚硬等。种子具有休眠特性是植物适应环境的一种表现，具有休眠特性的农作物种子在高温多雨地区可防止穗发芽；对温带作物来说，种子形成后进入休眠，以避免严冬的伤害。但种子休眠对农业生产也常带来一些困难，如处于深休眠的种子到播种时往往因难以发芽而造成迟发、缺苗，须以适当处理打破休眠，促进萌发。由于杂草种子有明显的休眠期，且休眠时间长短不一，大田除草常因草苗陆续出土而需进行多次。
种子，由于自身原因，在环境条件适合的情形下，仍不能萌芽。
种子休眠是指活种子在适宜条件下仍不能萌发，是一些植物的特性。
种子的休眠：在适宜发芽的条件下，作物种子和供繁殖的营养器官暂时停止萌发的现象。