普通大豆与转基因大豆从本质有区别，目前还是在探讨之中。
国内暂时没有转基因大豆品种，外观无法区别。
转基因大豆比非转基因大豆个头大，漂亮。但是发芽率低。
转基因大豆是黄烂烂的,圆圆的，果粒大,又匀称,甚是漂亮的。非转基因大豆外观亮黄，籽粒饱满，略呈椭圆形，与转基因大豆最大的区别在于豆脐呈黄褐色。
外观上应该没有区别，营养成分应该有区别。
最大的区别就是物质组成的基因有差别，转基因大豆，有非大豆体以外和基因组成。
产量不同，发芽的能力不同，颜色大小不一样。
没有区别的，转基因大豆与普通大豆的区别，仅在于转基因大豆中的基因序列里被人为引入了可抵抗杀虫剂、除草剂或者是病虫害的基因片段，对大豆本身的营养成分并不构成影响。
转基因大豆抗病虫草害能力比普通大豆强。