根腐病发生在雪松的根部，进而发展到干及全株。根部染病后在根尖、分叉处或根端部分产生病斑，以新根发生为多，病斑沿根扩展，初期病斑浅褐色，后深褐至黑褐色，皮层组织水渍状坏死。
尤其在雨季到来时，注意排水避免土壤过湿，以防根部腐烂，同时可用尿素+新高脂膜浇灌根际，促进树木生长，提高抗病力。
在雪松根腐病严重发生区，在病害发生期到来之前，可喷施新高脂膜+护树大将军促进树林生长，提高抗病能力。同时加强苗床保护预防措施，病害发生初期，可以使用根施通+护树大将军进行灌根，提高植物抗病能力。同时使用植物细胞免疫因子以寄主植物抗病机理及利用病菌毒性变异原理，控制植物生理性病害和侵染性病害繁衍。