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秧苗带杀菌剂或者，化学药剂防治。
可在插秧前2-3天叶面喷施灭蝇胺、阿维吡虫啉、溴氰菊酯等药剂提前预防，对潜叶蝇有很好的防效。
秧苗带杀菌剂式者用化学药剂防治。
(1)及时清除稻田杂草。(2)主防2代，杀灭初孵幼虫兼治成虫。用药种类参见菲岛毛眼水蝇。
水稻潜叶蝇发生后，可用2.5%高效氟氯氢菊酯500-600毫升/公顷+毒死蜱48%乳油300毫升/公顷对水120升左右喷雾。
发生初期叶面喷施阿维吡虫啉药剂。
