水稻细菌性茎基腐要用防治细菌性的药剂。
（1）选用抗病良种。如四梅2号、广陆矮4号、矮粳23、浙福802、农林百选、盐粳2号、武香粳、汕优6号、双糯4号、中粳574、南粳34等可因地制宜地选用。（2）培育壮苗，推广工厂化育苗，采用湿润育秧。适当增施磷、钾肥确保壮苗。要小苗直栽浅栽，避免伤口。（3）提倡水旱轮作，增施有机肥，采用配方施肥技术。
六月立秋因为立秋时间较早，天气凉快的较早，这对于农田的秋粮生长是不利的，秋粮生长需要的是高温高湿的环境，而过于早的降温，对于秋粮生长会带来不利的影响，所以很难取得好的收获，七月立秋炎热的时间较久，反倒利于庄稼的成长，虽然看似相差才一个月的时间，但对于庄稼的收获势必会产生影响。
水稻细菌性病害主要是用铜制剂。
首先排水搁田，再用添金、可杀得3000、噻菌铜、中生菌素等细菌药剂喷雾防治。
细菌性茎腐病很难防治，必须选择抗病品种，合理轮作，加强化学、农业等综合防治。
水稻细菌性茎基腐病可采用哂田和药物防治。
一是选用抗病品种；二是插秧时避免伤苗；三是秋翻地减少病菌；四是药剂防治可选用铜制剂。