香菜菌核病主要为害茎基部，其次是叶片。开始时，出现褪色水渍状病斑，后来变成淡褐色，迅速扩大，绕茎一圈，湿度大时，病部生有白色棉絮状菌丝，呈软腐状，后期在白霉层下面菌丝结成黑色菌核，严重时，病苗枯死。识别要点：潮湿时，病部表面长有白色棉絮状霉层，后期在茎表面形成有菌核，或剥开茎部可看到呈黑色的菌核。
幼苗、成株均可发病，主要为害茎，从茎基部开始出现水渍状软腐，致幼苗折倒枯死；成株能支撑几天，湿度大时，病部生出繁茂的棉絮状白色菌丝，向四周健株蔓延，致病组织腐烂，后期在菌丝间形成黑色鼠类状坚硬的菌核。该病腐烂时无异味别于欧氏茵软腐病。
主要侵染茎基部或茎分杈处，病斑扩展环绕茎一圈后向上向下发展，潮湿时，病部表面长有白色菌丝，随后皮层腐烂，内有黑色菌核。