从幼苗到抽穗都可受害，主要引起苗枯、茎基腐、秆腐和穗腐，其中为害最严重的是穗腐。防治方法。（1）选用抗（耐）病品种,（2）农业防治合理排灌，湿地要开沟排水。收获后要深耕灭茬，减少菌源。适时播种，避开扬花期遇雨。提倡施用酵素菌沤制的堆肥，采用配方施肥技术，合理施肥，忌偏施氮肥，提高植株抗病力。播种前进行石灰水浸种，方法参见小麦散黑穗病。(3)药剂防治。
小麦赤霉病发病原因。小麦赤霉病的发生流行受小麦生育期、气候条件、菌源量、品种抗性、农业生态环境及栽培管理措施等多种因素的影响，尤其与气象条件关系密切。一般来说，小麦抽穗后的温度条件都能满足病原菌发育生长，流行的关键是阴雨天气。当春季平均气温为9℃以上，小麦抽穗扬花期遇连续3天以上有一定降水量的阴雨和长时间结露天气，田间空气相对湿度达80%以上时，就可造成小麦赤霉病的发生和流行。赤霉病防治技术。小麦赤霉病一定要以提前预防为主，应在科学肥水管理、清沟理墒等农业防控措施基础上，抓住关键时期、及时喷施对症药剂预防是控制当季小麦赤霉病发生、降低毒素污染的重要措施。