小麦黑穗病是一种播种后出苗前在土壤传染病菌，出穗时发病，防治需要用多菌灵等农药拌种预防！
种子处理，拔除病株，药剂防治。
药剂处理：50%和穗安可湿性粉剂、25%粉锈宁可湿性粉剂、40%拌种双可湿性粉剂，用种子量的0.2%拌种均能收到良好效果。上述处理后的种子和包衣剂混合然后拌种，可以提高防治效果。有些药剂在拌种时注意不要超过规定量，以免发生药害。
小麦黑穗病防治的最有效方法是药剂拌种。
适期播种，合理轮作。播种不宜过迟过深，可促进幼苗早出土，减少病菌侵染的机会而减少发病。合理轮作倒茬，降低土壤病原数量。药剂拌种。药剂拌种是防治小麦腥黑穗病最经济有效的措施。可用咯菌腈、戊唑醇等药剂拌种。拌种药剂可选用2%戊唑醇干拌剂或湿拌剂100～150克拌麦种100千克或2.5%咯菌腈悬浮剂100～200毫升拌麦种100千克。均匀拌种后晾干播种。病田土壤药剂处理。病田应采取药剂拌种加土壤处理双管齐下的办法。每亩用70%甲基硫菌灵可湿性粉剂或50%多菌灵可湿性粉剂2公斤左右，或70%甲基托布津可湿性粉剂1-1.5公斤，拌细土45～50千克，均匀撒在地面，然后翻耕入土。
在小麦抽穗扬花期喷两次多菌灵等杀菌剂。
药剂防治，种子处理，合理轮作，适期播种。
在小麦抽穗期或齐穗期用粉锈宁防治。
加强田间管理及时喷撒病虫害药物。