病死鸡以小肠后段秸膜坏死为特征。小肠显著肿大至正常的2~3倍,肠管变短,肠道表面呈污灰黑色,肠壁变薄,肠腔内充盈着灰白色或黄白色服样渗出物,和膜呈严重纤维素性坏死。
剖检变化急性爆发时,病死鸡呈严重脱水状态,刚病死鸡打开腹腔即可闻到尸腐臭味。主要病变集中在肠道,尤以中、后段较为明显。病死鸡以小肠后段秸膜坏死为特征。小肠显著肿大至正常的2~3倍,肠管变短,肠道表面呈污灰黑色,肠壁变薄,肠腔内充盈着灰白色或黄白色服样渗出物,和膜呈严重纤维素性坏死。本病与小肠球虫合并感染时,除可见到上述病变外,在小肠浆膜表面还可见到大量针尖状大小的出血点和灰白色小点,肠内充满黑红色服样渗出物,粘膜呈现更为严重的坏死。