秆锈病的感染率在1-5%、叶锈病的感染率在5-10%、条锈病的感染率在1-2%，这三个阶段采用农药喷洒对小麦锈病有很好的抑制作用，具体方式如下。可使用500毫升左右25%丙环唑乳油兑水750千克喷洒，也可使用600克浓度为25%的粉锈宁可湿性粉剂和一定量水混合进行喷洒。
防治方法可结合防治小麦吸浆蚜虫的方法，25%丙环唑乳油每亩40毫升或35%戊唑醇悬浮剂，每亩20毫升，30%醚菌酯20g每亩，兑水30kg，均匀喷雾，喷雾时要注意喷雾均匀，注意打透植株下部叶片。
小麦白粉病可以结合用较大剂量戊唑醇、氟环唑（每亩用纯药10克左右）防治纹枯病，兼防白粉病，加喷醚菌酯或嘧菌酯、吡唑醚菌酯以提高对白粉病的防效。醚菌酯对白粉病的活性高于嘧菌酯、吡唑醚菌酯，病害暴发时优先选用醚菌酯。
化学防治，用25%丙环唑乳油每亩40ml或35%戊唑醇悬浮剂，每亩20毫升，30%谜菌酯20克每亩兑水30公斤，均匀喷雾。
小麦白粉病的化学防治用粉绣宁喷雾。
小麦的白粉病可用粉锈宁防治。